1. Proteiner:
* aminosyrasekvenser: Att jämföra aminosyrasekvenserna av homologa proteiner (proteiner med delade förfäder) kan avslöja evolutionära förhållanden. Detta beror på att mutationer ackumuleras över tid, vilket resulterar i skillnader i aminosyrasekvenser mellan arter.
* proteinstruktur: Den tredimensionella strukturen för proteiner kan också vara informativ. Liknande proteinstrukturer återspeglar ofta delad evolutionär historia.
2. Kolhydrater:
* polysackaridstruktur: Även om mindre vanligt används än proteiner eller DNA, kan strukturen för komplexa kolhydrater (som de som finns i cellväggar) vara informativa, särskilt för att studera förhållanden mellan nära besläktade arter.
3. Lipider:
* fettsyrasammansättning: Sammansättningen av fettsyror i membran kan användas för att studera evolutionära förhållanden, särskilt bland bakterier och archaea.
4. Metaboliter:
* Metaboliska vägar: Att jämföra enzymer och vägar som är involverade i metabolism kan avslöja evolutionära förbindelser. Organismer med liknande metaboliska vägar kommer sannolikt att vara närmare besläktade.
5. Små molekyler:
* sekundära metaboliter: Dessa är små molekyler som produceras av organismer som inte är direkt involverade i viktiga metaboliska processer men ofta spelar roller i försvar, signalering eller andra funktioner. Närvaron eller frånvaron av specifika sekundära metaboliter kan användas för att dra slutsatser.
Faktorer att tänka på:
* Evolutionär ränta: Olika molekyler utvecklas i olika hastigheter. Till exempel utvecklas DNA relativt långsamt, medan proteiner kan utvecklas snabbare. Valet av molekyl bör vara lämpligt för tidsskalan för de evolutionära relationerna som undersöks.
* Tillgänglighet av data: Tillgängligheten för sekvens eller strukturella data för molekylen i fråga är avgörande för analys.
* Homologi: Att säkerställa att molekylerna som jämförs är verkligen homologa (dela en gemensam förfader) är avgörande för korrekt evolutionär inferens.
Det är viktigt att notera att användning av en kombination av olika molekylära datakällor ger den mest robusta och omfattande förståelsen av evolutionära relationer. Denna metod, känd som filogenomik , utnyttjar styrkorna hos varje typ av molekyl för att skapa ett mer exakt och detaljerat evolutionärt träd.
