1. Länkanalys:
* Rekombinationsfrekvens: Detta är hörnstenen i genetisk kartläggning.
* Hur det fungerar:
* Under meios utbyter kromosomer genetiskt material (korsning) och skapar nya kombinationer av alleler.
* Ju närmare två generna är på en kromosom, desto mindre troligt är de att separeras genom att korsa över.
* Frekvensen för rekombination (hur ofta generna är separerade) är direkt relaterad till avståndet mellan dem.
* Data: Du måste analysera avkommor från kors för att bestämma frekvensen för rekombination mellan parpar.
2. Fysisk kartläggning:
* Fysiska avstånd mäts i baspar. Denna metod analyserar direkt DNA -sekvenser.
* typer av data:
* Begränsningsfragmentlängd Polymorfismer (RFLP): Skillnader i DNA -sekvens som påverkar var restriktionsenzymer skär DNA.
* Enkel nukleotidpolymorfismer (SNP): Enkel basparvariationer i DNA -sekvenser.
* Microsatellites: Upprepade DNA -sekvenser som varierar i längd och ger markörer för fysisk kartläggning.
* Sekvensdata: Direkt sekvensering av DNA för att bestämma den exakta ordningen för nukleotider.
3. Andra tekniker:
* kromosomal banding: Denna metod använder färgämnen för att visualisera bandmönster på kromosomer. Även om det inte är exakt, kan det tillhandahålla allmänna platser för gener inom kromosomregioner.
* fluorescens in situ hybridisering (fisk): Fluorescerande sonder riktar sig till specifika DNA -sekvenser. Detta gör att du kan visualisera var en gen finns på en kromosom.
Nyckelöverväganden:
* Upplösning: Fysisk kartläggning ger mer exakta genplatser än kopplingsanalys.
* kompletterande tekniker: Ofta används en kombination av tillvägagångssätt för att få en mer fullständig förståelse för genpositioner.
Exempel:
Föreställ dig att du kartlägger tre gener (A, B och C) på en kromosom.
* Länkanalys: Du kanske upptäcker att gen A och gen B rekombinerar med en frekvens av 10%, medan gen B och gen C rekombinerar med en frekvens av 2%. Detta antyder att A och B är längre från varandra än B och C.
* Fysisk kartläggning: Du kan sedan sekvensera DNA -regionen som innehåller dessa gener och upptäcka att A och B är separerade med 100 000 baspar, medan B och C är separerade med 20 000 baspar. Detta bekräftar de relativa avstånd som fastställts genom kopplingsanalys.
Låt mig veta om du vill ha mer information om någon av dessa metoder eller har ytterligare frågor!
