* Närvaro av klorofyll: Den mest direkta observationen är närvaron av klorofyll. Klorofyll är pigmentet som absorberar ljusenergi för fotosyntes. Om organismen är grön eller har en grönaktig nyans kan det indikera närvaron av klorofyll. Detta kan observeras visuellt eller med ett mikroskop.

* Produktion av syre: Autotrofer släpper syre som en biprodukt av fotosyntes. Att mäta syrenivåerna runt organismen eller observera bubblor av syre som frigörs skulle vara en stark indikator.

* Närvaro av fotosyntetiska strukturer: Vissa organismer, som alger, har specialiserade strukturer för fotosyntes, såsom kloroplaster. Att observera dessa strukturer under ett mikroskop skulle vara ett definitivt tecken på autotrofi.

* tillväxt i frånvaro av ekologisk mat: Om en organisme kan växa och trivas i en miljö som saknar ekologiska matkällor (som i Deep Ocean), antyder det att det får sina näringsämnen genom autotrofi.

* Kolfixering: Med hjälp av radioaktiva kolspårningstekniker kan forskare spåra upptag och införlivande av koldioxid i organiska molekyler. Detta är en definitiv indikator på autotrofisk aktivitet.

Viktig anmärkning: Vissa organismer kan växla mellan autotrofisk och heterotrof näring, beroende på miljöförhållandena.