* fossilrekord: Fossiler ger direkta bevis på tidigare livsformer och deras evolutionära historia. De kan avslöja den kronologiska utseendet på olika filla och hjälpa till att spåra deras släkt.
* Jämförande anatomi: Jämförelse av de anatomiska strukturerna för olika fila kan avslöja likheter och skillnader som antyder gemensamma förfäder eller konvergent utveckling. Till exempel föreslår närvaron av en notokord i kordater en delad förfader med annan fila som har denna struktur.
* Molekylärbiologi: Jämförelse av DNA, RNA och proteinsekvenser kan ge kraftfulla bevis för evolutionära relationer. Genom att analysera skillnaderna och likheterna i dessa molekyler kan forskare rekonstruera fylogenetiska träd som visar den evolutionära historien för olika phyla.
* Utvecklingsbiologi: Jämförelse av den embryonala utvecklingen av olika djurfyla kan avslöja likheter i utvecklingsvägar, vilket tyder på delade förfäder. Till exempel indikerar närvaron av ett blastula -stadium i många djurfyla ett gemensamt utvecklings ursprung.
* biogeografi: Den geografiska fördelningen av Animal Phyla kan ge ledtrådar om sin evolutionära historia. Till exempel antyder distributionen av pigvar i Australien att de utvecklades isolerat från andra däggdjur.
Det är viktigt att notera att dessa olika bevislinjer ofta används i kombination för att ge en omfattande förståelse av evolutionära förhållanden mellan djurens phyla. Fältet för evolutionär biologi utvecklas ständigt när nya bevis dyker upp och analytiska tekniker förbättras.
