1. Filogenetisk klassificering (baserad på evolutionära relationer):
* 16S rRNA -gensekvensering: Denna metod jämför sekvenserna för den 16S ribosomala RNA -genen, en mycket konserverad gen som finns i alla levande organismer. Skillnader i gensekvensen avslöjar evolutionära förhållanden mellan archaea.
* Andra molekylära markörer: Forskare använder också andra gener, som de som är involverade i energimetabolism, för att ytterligare förfina klassificeringen.
2. Metabolisk klassificering (baserad på energikällor och metabolism):
* metanogener: Producera metan som en biprodukt av deras metabolism och finns i anaeroba miljöer.
* halofiler: Trivs i mycket salt miljöer som salt sjöar och saltlägenheter.
* Termofiler: Överlev i extremt heta miljöer som varma källor och hydrotermiska ventiler.
* acidofiler: Föredrar sura miljöer.
* alkalofiler: Trivs i alkaliska miljöer.
3. Cellulära funktioner:
* cellväggens sammansättning: Archaea har unika cellväggar som skiljer sig från bakterier. Vissa archaea har cellväggar bestående av pseudopeptidoglykan eller till och med saknar cellväggar helt.
* membranlipider: Archaea har unika membranlipider som skiljer sig från bakterier och eukaryoter.
4. Miljöfaktorer:
* Habitat: Archaea finns i ett brett spektrum av miljöer, inklusive extrema miljöer som varma källor, salt sjöar och djuphavsöppningar.
Det nuvarande klassificeringssystemet för archaea känner igen två huvudfila:
* euryarchaeota: Inkluderar metanogener, halofiler och termofiler.
* crenarchaeota: Innehåller många termofiler och acidofiler.
Andra mindre phyla har också identifierats, inklusive:
* thaumarchaeota
* nanoarchaeota
* Korarchaeota
* aigarchaeota
Klassificeringen av archaea utvecklas ständigt när nya arter upptäcks och ny information erhålls om deras evolutionära relationer och metaboliska förmågor.
Obs: Termen "archaebacteria" är föråldrad och används inte längre av forskare. Rätt termin är archaea .
