Han utvecklade ett system med binomial nomenklatur, som ger alla arter ett unikt tvådelat vetenskapligt namn (t.ex. * Homo sapiens * för människor). Han klassificerade också organismer i ett hierarkiskt system med kategorier, med början med de bredaste kategorierna (riket) och går ner till de mest specifika (arter). Detta system, som fortfarande används idag, har varit oerhört användbart för att organisera och förstå mångfalden i livet på jorden.