Geografisk isolering är en avgörande faktor vid artbildning eftersom den skapar barriärer som förhindrar genflöde mellan populationer av samma art. När populationer separeras av geografiska barriärer, såsom berg, floder eller hav, kan de inte blanda sig. Med tiden kan dessa isolerade populationer divergera genetiskt och bli reproduktivt isolerade. Denna process av allopatrisk artbildning är en viktig mekanism för bildandet av nya arter.

Det finns många exempel på geografisk isolering som leder till artbildning. Till exempel, Darwins finkar som Charles Darwin observerade under sin resa på HMS Beagle exemplifierar allopatrisk artbildning. De olika arterna av Darwins finkar avvek från en gemensam förfader när de koloniserade de olika öarna i Galapagos-skärgården. Med geografisk isolering spelade naturligt urval en betydande roll i variationerna i deras kroppsmorfologi, särskilt inom deras näbbstrukturer, som svar på specifika ekologiska nischer på varje ö.

Geografisk isolering är dock inte ett absolut krav för artbildning. Sympatisk artbildning och parapatrisk artbildning är två distinkta processer av artbildning som kan inträffa i frånvaro av fullständig geografisk isolering.