Ett team av forskare vid University of California har hittat ett sätt att syntetisera flera gener från en grupp mikroarraygenererade oligonukleotider. I deras tidning publicerad i tidningen Vetenskap , gruppen beskriver deras teknik, kallas DropSynth, hur bra det fungerar, och dess nackdelar.

Att syntetisera gener har blivit så populärt att det nu finns företag som gör det för sitt liv, men det är fortfarande ett dyrt förslag - nuvarande metoder kräver att små trådar sys in i sekvenser en i taget efter att de har skapats. I denna nya insats, forskarna rapporterar en en-gryts metod för gensyntes som kan leda till lägre kostnader.

För närvarande, gensyntes utförs med hjälp av en mikroarray, producerar DNA -oligonukleotider, som sedan måste sys ihop - teamet vid UoC började också med en mikroarray, men de gav först oligonukleotiderna en identifierande längd av gensekvensen, som de beskriver som en "streckkod". Nästa, de lade till mikropärlor med gratis streckkoder som kunde dra matchande oligonukleotider från en pool av olika typer av oligonukleotider. Resultatet blev en pool av mikropärlor, var och en hade en liten grupp av bundna oligonukleotider av samma typ. Teamet innesluter sedan var och en av mikropärlorna (och dess grupp av oligonukleotider) i en emulsionsdroppe med användning av vad de beskriver som en oligonukleotid- och oljeblandningsvirvel - i 30 sekunder. Efter det, enzymer inducerade alla oligonukleotider i en enda droppe att smälta samman (via polymerascykelaggregat), vilket resulterar i en önskad sekvens. Sekvenserna avlägsnades sedan från emulsionen redo att användas.

Processen är bättre än konventionella metoder, föreslår laget, eftersom den erbjuder tillgång till en genpool till i stort sett samma kostnad som en oligonukleotidpool - det tillför inte mycket. Tyvärr, det är en ganska stor nackdel. Processen, de noterar, är "rörig, "för att den bara är cirka 5 procent effektiv - inte tillräckligt bra för användning i tillverkningsprocesser. På en mer positiv not, metoden kan användas för att skapa stora bibliotek med gener för olika ändamål, till mycket liten kostnad. Det kan också användas i forskningsinsatser, särskilt de som är involverade i proteindesign.

© 2018 Phys.org