Vakuoler är stora hålrum eller säckar som finns i växtceller, protozoer och olika andra organismer. I växtceller är vakuoler särskilt framträdande och upptar ofta en stor del av cellvolymen. De är membranbundna fack som är involverade i en rad cellulära funktioner, inklusive lagring, avfallshantering och bibehållande av cellens form och turgor. Till exempel lagrar växtceller olika ämnen som vatten, mineralsalter, pigment och sockerarter i sina vakuoler. Protozoer och vissa andra mikroorganismer har också vakuoler som spelar en roll vid lagring av näringsämnen, matsmältning och osmoreglering.