Det finns två huvudtyper av kvävefixerande bakterier:
* frittlevande kvävefixerande bakterier: Dessa bakterier lever i jorden och vatten och fixar kväve oberoende.
* Symbiotiska kvävefixerande bakterier: Dessa bakterier lever i ett ömsesidigt fördelaktigt förhållande med växter, som vanligtvis bildar knölar på rötter av baljväxter (t.ex. bönor, ärtor, linser).
Medan vissa andra organismer som cyanobakterier också kan fixa kväve, utförs majoriteten av kvävefixering i biosfären av dessa två grupper av bakterier.