Även om det också finns några svampar, virus och archaea i tarmen, utgör bakterier de allra flesta (uppskattas vara biljoner bakterier). Dessa bakterier tillhör tusentals olika arter, med den vanligaste phyla är:
* Bacteroidetes: Dessa bakterier spelar en roll i att bryta ner komplexa kolhydrater och producera kortkedjiga fettsyror.
* Firmicutes: Dessa bakterier är involverade i produktionen av vitaminer och nedbrytningen av dietfibrer.
* Actinobacteria: Dessa bakterier bidrar till utvecklingen av immunsystemet och hjälper till med näringsabsorption.
* Proteobacteria: Medan vissa proteobakterier är fördelaktiga, kan andra vara patogena och bidra till tarminflammation.
Den specifika sammansättningen av tarmfloraen varierar från person till person, påverkad av faktorer som genetik, kost, livsstil och mediciner.
