* kärnan: Prokaryoter saknar en verklig kärna. Deras DNA är beläget i en region som kallas nukleoiden, som inte är innesluten av ett membran.
* mitokondrier: Prokaryoter har inte mitokondrier, som är kraftverk från eukaryota celler. De genererar energi genom cellulär andning, men detta inträffar i cellmembranet.
* endoplasmatisk retikulum (ER): Prokaryoter saknar ER, ett nätverk av membran involverade i proteinsyntes och lipidmetabolism i eukaryoter.
* Golgi -apparaten: Prokaryoter har inte en Golgi -apparat, som är involverad i förpackning och modifiering av proteiner i eukaryota celler.
* lysosomer: Prokaryoter saknar lysosomer, som är organeller som är ansvariga för att bryta ner cellulärt avfall i eukaryota celler.
* kloroplaster: Prokaryoter, med undantag för cyanobakterier, har inte kloroplaster, som är platserna för fotosyntes i eukaryota celler.
* Centrioles: Prokaryoter saknar centrioler, som är involverade i celldelning i eukaryota celler.
Sammanfattningsvis saknar prokaryoter alla membranbundna organeller som finns i eukaryota celler. Deras genetiska material är beläget i nukleoiden och de utför energiproduktion och andra väsentliga processer i cellmembranet och cytoplasma.