Emellertid varierar den specifika platsen och mekanismerna för cellulär andning beroende på organisismens cellstruktur:
* eukaryoter (djur, växter, svampar): Cellulär andning förekommer främst i mitokondrierna , som är specialiserade organeller som är ansvariga för energiproduktion.
* prokaryoter (bakterier, archaea): Cellulär andning sker i cytoplasma och på plasmamembranet , när de saknar mitokondrier.
Därför, medan alla levande organismer utför cellulär andning, kan den exakta processen och platsen skilja sig ut baserat på deras cellulära organisation.