1. Högre upplösning. Elektronmikroskop kan uppnå mycket högre upplösningar än optiska mikroskop, vilket gör att forskare kan se mycket mindre föremål. Detta beror på att elektroner har en mycket kortare våglängd än ljusvågor, så de kan användas för att skapa bilder med mindre pixlar.

2. 3D-bilder. Elektronmikroskop kan användas för att skapa 3D-bilder av objekt, vilket kan ge en mer detaljerad förståelse av deras struktur. Detta beror på att elektroner kan penetrera föremål djupare än ljusvågor, så de kan användas för att samla in information från en större volym material.