i öster:
* Karibiska havet: Detta stora hav bildar den östra gränsen till Mesoamerica.
* Mexikanska golfen: Mexikanska golfen ligger öster om Mesoamerica och gränsar till Yucatan -halvön.
i väster:
* Stilla havet: Stilla havet bildar den västra gränsen till Mesoamerica.
Inom MesoAmerica:
* Lake Nicaragua: Detta är den största sjön i Centralamerika, som ligger i Nicaragua.
* sjön Atitlán: Denna vackra sjö ligger i Guatemala, omgiven av vulkaner.
* Lake Izabal: Denna stora sjö ligger i Guatemala, ansluten till Karibiska havet vid en kort flod.
* Lake Chapala: Detta är den största sjön i Mexiko, belägen i delstaten Jalisco.
* Lake Texcoco: Denna sjö, nu mestadels tömd, var historiskt viktig för den aztekiska civilisationen.
Mesoamerica har också ett antal floder, inklusive Usumacinta -floden, floden Grijalva, Motagua -floden och floden San Juan.