1. Nuclear Pore Complex: Kärnporkomplexet (NPC) är en stor proteinstruktur som styr rörelsen av molekyler mellan cytoplasman och kärnan. Den fungerar som en selektiv barriär som tillåter passage av vissa molekyler samtidigt som den blockerar andra. HIV-DNA är för stort för att passivt diffundera genom NPC, och specifika transportmekanismer krävs för dess inträde.
2. TRIM5α: TRIM5α är ett cellulärt protein som spelar en avgörande roll för att blockera HIV-infektion. Det tillhör familjen tripartite motiv (TRIM) av proteiner och finns i cellernas cytoplasma. TRIM5α binder till HIV-kapsiden, som kapslar in det virala RNA-genomet, och förhindrar att den virala kärnan tas bort. Genom att bibehålla kapsidens integritet blockerar TRIM5α frisättningen av HIV-DNA till cytoplasman och efterföljande inträde i kärnan.
3. Cyklofilin A: Cyclophilin A (CypA) är ett värdcellsprotein som införlivas i HIV-virion under viral montering. CypA interagerar med HIV-kapsiden och underlättar avbeläggningsprocessen, vilket möjliggör frisättning av viralt RNA i cytoplasman. Vissa polymorfismer i CypA-genen ger emellertid resistens mot HIV-infektion genom att försämra interaktionen mellan CypA och den virala kapsiden. Detta förhindrar att viruset tas bort och blockerar inträdet av HIV-DNA i cellkärnan.
4. LEDGF/p75: Linsepitelhärledd tillväxtfaktor (LEDGF/p75) är ett cellulärt protein som interagerar med HIV-integrasenzymet. Integrase ansvarar för att integrera det virala DNA:t i värdcellens genom, ett kritiskt steg i den virala livscykeln. LEDGF/p75 binder normalt integras till kromatinet, vilket underlättar integrationsprocessen. Vissa LEDGF/p75-isoformer kan emellertid störa interaktionen mellan integras och kromatinet och därigenom hämma integrationen av HIV-DNA i värdgenomet.
5. APOBEC3-proteiner: APOBEC3-proteiner är en familj av cellulära enzymer som kan deaminera cytidin till uridin i DNA- och RNA-molekyler. APOBEC3G, i synnerhet, är känt för att hämma HIV-infektion genom att deaminera det virala DNA:t under omvänd transkription, den process genom vilken det virala RNA-genomet omvandlas till DNA. Genom att introducera fel i det virala DNA:t äventyrar APOBEC3G integriteten hos det virala genomet och förhindrar dess integration i värdcellens kromosom.
Dessa cellulära försvarsmekanismer fungerar tillsammans som barriärer för att blockera inträdet av HIV-DNA i cellkärnan, vilket begränsar virusets förmåga att etablera infektion och replikera. Att förstå dessa mekanismer är avgörande för att utveckla nya terapeutiska strategier för att bekämpa HIV-infektion.