* Målidentifiering: Forskaren har redan identifierat ett specifikt protein som ett potentiellt mål för läkemedelsutveckling.
* Bibliotekets screening: Forskaren söker efter en liten molekyl som binder till målproteinet. Detta innebär vanligtvis att screening av ett bibliotek med tusentals eller miljoner små molekyler.
* Hög genomströmning: För att screena ett så stort bibliotek kommer forskaren att använda automatiserade tekniker för att snabbt testa varje molekyls förmåga att binda till proteinet.
* analysutveckling: Forskaren måste utveckla en specifik analys (experiment) för att mäta bindningsaffiniteten för varje molekyl till proteinet. Detta kan göras med metoder som:
* ELISA (enzymbunden immunosorbentanalys): Denna metod använder antikroppar för att detektera proteinet och den bundna molekylen.
* fluorescenspolarisering: Denna metod mäter förändringen i polarisering av fluorescerande ljus när molekylen binder till proteinet.
* Ytplasmon Resonance (SPR): Denna teknik mäter molekylens bindande kinetik till proteinet i realtid.
Sammanfattningsvis: Forskaren använder en screeningsmetod med hög kapacitet för att identifiera små molekyler som binder till ett specifikt protein. Detta är en vanlig strategi i läkemedelsupptäckten, där målet är att hitta föreningar som kan modulera aktiviteten hos ett protein involverat i en sjukdom.